RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D4O60343 1298 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARL3P36405 182 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 STOML3Q8TAV4 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PROX1Q92786 737 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DLG3Q92796 817 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A13Q96H72 371 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 WDR24Q96S15 920 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PITPNM1O00562 1244 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SNAPC5O75971 98 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PROS1P07225 676 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA8P13928 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SAT1P21673 171 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HOXC13P31276 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A3P53794 718 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAD23AP54725 363 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CDH8P55286 799 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EHHADHQ08426 723 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GALEQ14376 348 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 USP45Q70EL2 814 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf57Q99622 126 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF175Q9Y473 711 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VSTM5A8MXK1 200 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 H3BUI4 141 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 QDPRP09417 244 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RBP1P09455 135 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN6P29350 595 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AP1S2P56377 157 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-21P61565 698 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NOMO3P69849 1222 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NOMO1Q15155 1222 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM189A2Q15884 450 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO43Q4G163 708 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ULK3Q6PHR2 472 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 STRADAQ7RTN6 431 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BADQ92934 168 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IRF7Q92985 503 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAVIN3Q969G5 261 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC5Q96C12 935 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRFN5Q96NI6 719 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BIRC8Q96P09 236 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SAR1AQ9NR31 198 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PADI3Q9ULW8 664 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQY0 241 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C74A6NCV1 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 H3BMM5 538 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRM6O15303 877 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAMP2O60895 175 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 JUNDP17535 347 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FSHRP23945 695 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EPHB2P29323 1055 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BLKP51451 505 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARFIP1P53367 373 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms