RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540900.7

NSRP1-206, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 2,057 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-206	ENST00000540900	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	INPP4B	O15327	924 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	CLIC3	O95833	236 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	MT-CO1	P00395	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	NPPA	P01160	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	KCNC1	P48547	511 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	BNIP3	Q12983	259 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	RCAN2	Q14206	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	CRY1	Q16526	586 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	FATE1	Q969F0	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSRP1-206	ENST00000540900	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	UBXN8	O00124	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	EED	O75530	441 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	S1PR4	O95977	384 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BCL10	O95999	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MMP3	P08254	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PRR35	P0CG20	571 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CD1D	P15813	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	HTR1E	P28566	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SUOX	P51687	545 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CDKN2D	P55273	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	WNT3A	P56704	352 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	GSTM4	Q03013	218 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	GRB7	Q14451	532 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BROX	Q5VW32	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	EDEM1	Q92611	657 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PTER	Q96BW5	349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900		K7EPI3	171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ABCB7	O75027	752 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CLPX	O76031	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PRSS23	O95084	383 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SNAP29	O95721	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ALB	P02768	609 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FUCA1	P04066	466 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ALDH2	P05091	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FDXR	P22570	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	LIPE	Q05469	1076 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RNF34	Q969K3	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	HGF	P14210	728 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TSPAN8	P19075	237 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MATN1	P21941	496 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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