RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM38	O00635	465 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TPP1	O14773	563 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	AURKA	O14965	403 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	USP12	O75317	370 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	METTL18	O95568	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CRTAM	O95727	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	HMGCL	P35914	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FDFT1	P37268	417 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GNG11	P61952	73 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PDE1B	Q01064	536 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	NR0B2	Q15466	257 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	YY2	O15391	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SOD1	P00441	154 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	IVL	P07476	585 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CDK4	P11802	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BPI	P17213	487 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PML	P29590	882 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ACADVL	P49748	655 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BIRC2	Q13490	618 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OLIG2	Q13516	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PEX6	Q13608	980 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SEPT6	Q14141	434 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CLPB	Q9H078	707 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059		B4DGG1	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	AP2A1	O95782	977 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM5	P06731	702 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ACP1	P24666	158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ADRA1A	P35348	466 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	POLD2	P49005	469 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ILK	Q13418	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS13	Q6UX07	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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