RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CEP76Q8TAP6 659 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 HASPINQ8TF76 798 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 FGF14Q92915 247 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 IQCDQ96DY2 449 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 RNF31Q96EP0 1072 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC46Q96FV0 321 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 STK33Q9BYT3 514 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PANK4Q9NVE7 773 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CA14Q9ULX7 337 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TRIP11Q15643 1979 aa4.4□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TSC2P49815 1807 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PIPSLA2A3N6 862 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 AQP12BA6NM10 295 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 LACTBL1A8MY62 500 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PDXKO00764 312 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TOR1BO14657 336 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF217O75362 1048 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 RASSF9O75901 435 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 APBB3O95704 486 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 MYL4P12829 197 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TYRP1P17643 537 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SYT1P21579 422 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 GABRR2P28476 465 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 IFNAR2P48551 515 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ITGA8P53708 1063 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SEC24CP53992 1094 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ARPP19P56211 112 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SNX16P57768 344 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 OSTNP61366 133 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 STIM1Q13586 685 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 RUNX3Q13761 415 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM14Q14142 442 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF7Q14155 803 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 BECN1Q14457 450 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 KRT72Q14CN4 511 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PSMD6Q15008 389 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 VITQ6UXI7 678 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 RNF44Q7L0R7 432 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SYT13Q7L8C5 426 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CAVIN3Q969G5 261 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 STRA6Q9BX79 667 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM9Q9C026 710 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 DCLK3Q9C098 648 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SIK2Q9H0K1 926 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 SNX25Q9H3E2 840 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 PPCSQ9HAB8 311 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 VPS45Q9NRW7 570 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC1Q9NV70 894 aa4.39□□□□□ -1.71
HDAC2-216ENST00000523628 INTS13Q9NVM9 706 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms