RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 STPG1Q5TH74 334 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ALS2CLQ60I27 953 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CES3Q6UWW8 571 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PALM2Q8IXS6 379 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ASB12Q8WXK4 309 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SNX19Q92543 992 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CD84Q9UIB8 345 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ACACBO00763 2458 aa20.01■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MEI4A8MW99 385 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 USP1O94782 785 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MYBL2P10244 700 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 NUDT1P36639 197 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 DCDC1P59894 354 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PRAMEP78395 509 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF765Q7L2R6 523 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FOXJ1Q92949 421 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 AP2M1Q96CW1 435 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MFSD3Q96ES6 412 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF778Q96MU6 729 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 EDEM2Q9BV94 578 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FAM83DQ9H4H8 585 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FKBPLQ9UIM3 349 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 APPL1Q9UKG1 709 aa20■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SLC31A1O15431 190 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 GM2AP17900 193 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 KCNA4P22459 653 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CRYMQ14894 314 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC14Q15048 493 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 AGERQ15109 404 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM135Q86UB9 458 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 DEFB119Q8N690 84 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 GPR26Q8NDV2 337 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 OR13J1Q8NGT2 312 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 OR6P1Q8NGX9 317 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 BIRC7Q96CA5 298 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 C9orf72Q96LT7 481 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ABCG8Q9H221 673 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TREX1Q9NSU2 369 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 RAB21Q9UL25 225 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 DMTF1Q9Y222 760 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CHD8Q9HCK8 2581 aa19.99■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 METTL12A8MUP2 240 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CCL22O00626 93 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 LATO43561 262 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 IGHV4-34P06331 123 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FAM153BP0C7A2 387 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 AKT2P31751 481 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ACVR1Q04771 509 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FAM153CQ494X1 144 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MAP9Q49MG5 647 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FAM151BQ6UXP7 276 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 UNC5AQ6ZN44 842 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ARMCX6Q7L4S7 300 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 RELL1Q8IUW5 271 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 DENND6BQ8NEG7 585 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 HDAC10Q969S8 669 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TBATAQ96M53 351 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 HSPA12BQ96MM6 686 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 TTC25Q96NG3 672 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SPATA16Q9BXB7 569 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa19.98■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 LNP1A1A4G5 178 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 H7C0S8 307 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PCCBP05166 539 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PYGLP06737 847 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 PSMA3P25788 255 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 MC4RP32245 332 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 ARSDP51689 593 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 DPTQ07507 201 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 FGL2Q14314 439 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 LONRF1Q17RB8 773 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 STEAP4Q687X5 459 aa19.97■□□□□ 0.79
SMIM20-201ENST00000506197 RAET1GQ6H3X3 334 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms