RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 CTSEP14091 401 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CKMT2P17540 419 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 POLD2P49005 469 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 GEMP55040 296 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CDK3Q00526 305 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SLC14A2Q15849 920 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ALS2CLQ60I27 953 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CREG2Q8IUH2 290 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 APOLD1Q96LR9 279 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 FICDQ9BVA6 458 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TEX101Q9BY14 249 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ZNF711Q9Y462 761 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 U3KQA8 63 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 FAM149AA5PLN7 773 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 YY2O15391 372 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 USP12O75317 370 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 RFPL3O75679 317 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ANXA9O76027 345 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 DKK1O94907 266 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TRIM16O95361 564 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 FUCA1P04066 466 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ANXA6P08133 673 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ALPPL2P10696 532 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SPINT3P49223 89 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SHC2P98077 582 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 DPTQ07507 201 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MPP3Q13368 585 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PRPSAP1Q14558 356 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PARP6Q2NL67 630 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 P3H1Q32P28 736 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CCDC89Q8N998 374 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ATL2Q8NHH9 583 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 KNTC1P50748 2209 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SPEGQ15772 3267 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PRSS38A1L453 326 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CEACAM5P06731 702 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 KELP23276 732 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ADRA1AP35348 466 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 GNPDA1P46926 289 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 BLKP51451 505 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CYP1B1Q16678 543 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 GPR26Q8NDV2 337 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CPED1A4D0V7 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 LMO7DNF2Z398 122 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 PHF2O75151 1096 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 CKMT1AP12532 417 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 ACP1P24666 158 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 TEAD1P28347 426 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 VPS41P49754 854 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-214ENST00000498219 TERF1P54274 439 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms