RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498189.1

BBS9-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 2

Gene BBS9, Length 614 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-215	ENST00000498189	FZD2	Q14332	565 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NFATC4	Q14934	902 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NCAPH	Q15003	741 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PDK2	Q15119	407 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	DPYSL2	Q16555	572 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	ODF2	Q5BJF6	829 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	TRNP1	Q6NT89	227 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	USP45	Q70EL2	814 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SLC25A45	Q8N413	288 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	IFI44	Q8TCB0	444 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	LMX1A	Q8TE12	382 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	UBXN4	Q92575	508 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	ZNF653	Q96CK0	615 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	APOLD1	Q96LR9	279 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	AGAP3	Q96P47	875 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	BOC	Q9BWV1	1114 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	KL	Q9UEF7	1012 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	ZNF487	B1APH4	448 aa		6.97	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	EPHB6	O15197	1021 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	FFAR2	O15552	330 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NDUFB5	O43674	189 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CD160	O95971	181 aa		6.97	□□□□□ -1.29
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BBS9-215	ENST00000498189	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	DNAJC3	Q13217	504 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	KRT81	Q14533	505 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NR1I3	Q14994	352 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	C2CD6	Q53TS8	623 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	MARC1	Q5VT66	337 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	AFMID	Q63HM1	303 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	DPPA4	Q7L190	304 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PDZD3	Q86UT5	571 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	MDM1	Q8TC05	714 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	LGMN	Q99538	433 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	APOO	Q9BUR5	198 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	WDR26	Q9H7D7	661 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PDF	Q9HBH1	243 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	PADI4	Q9UM07	663 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SUFU	Q9UMX1	484 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	NEU3	Q9UQ49	428 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	KNL1	Q8NG31	2342 aa		6.96	□□□□□ -1.29
BBS9-215	ENST00000498189	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS9-215	ENST00000498189	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS9-215	ENST00000498189	POM121B	A6NF01	834 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS9-215	ENST00000498189	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS9-215	ENST00000498189	FAM72C	H0Y354	149 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS9-215	ENST00000498189	DFFA	O00273	331 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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