RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NUDT8Q8WV74 236 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NANOGQ9H9S0 305 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ILVBLA1L0T0 632 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 WDR47O94967 919 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SLC1A2P43004 574 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HLCSP50747 726 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DGKQP52824 942 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NR6A1Q15406 480 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LSMEM2Q8N112 164 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ATL1Q8WXF7 558 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 C3orf30Q96M34 536 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NUAK2Q9H093 628 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 USP21Q9UK80 565 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SATB2Q9UPW6 733 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.93□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KRT87PA6NCN2 255 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 UBXN8O00124 270 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CAPN3P20807 821 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LRP8Q14114 963 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 S100ZQ8WXG8 99 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 WDCPQ9H6R7 721 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF221Q9UK13 617 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ABCB7O75027 752 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TNFRSF21O75509 655 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 AP2A1O95782 977 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RBP1P09455 135 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KCNAB2Q13303 367 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SDE2Q6IQ49 451 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ANKFN1Q8N957 763 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 STYXQ8WUJ0 223 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 AKT1S1Q96B36 256 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RGS18Q9NS28 235 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CMTM6Q9NX76 183 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SNTG2Q9NY99 539 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RNF112Q9ULX5 631 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM72CH0Y354 149 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 AZIN1O14977 448 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DNTTP04053 509 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 BMP2P12643 396 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LMO2P25791 158 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DCKP27707 260 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HTR1BP28222 390 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ARSFP54793 590 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NAB1Q13506 487 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HERC3Q15034 1050 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SLC36A3Q495N2 470 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM72BQ86X60 149 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CD274Q9NZQ7 290 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms