RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 DMDP11532 3685 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC34A8MYJ7 566 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 I3L4J1 428 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NPC1O15118 1278 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 INPPL1O15357 1258 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ASAP2O43150 1006 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PI15O43692 258 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NEMFO60524 1076 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAMEF2O60811 474 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MED24O75448 989 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLITRK3O94933 977 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ANXA6P08133 673 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FDPSP14324 419 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MATN1P21941 496 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GLRA2P23416 452 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DUSP1P28562 367 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GALNSP34059 522 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GLUD2P49448 558 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CLCN4P51793 760 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ARPP19P56211 112 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PTENP60484 403 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OSTNP61366 133 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NTHL1P78549 312 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC14A1Q13336 389 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TDGQ13569 410 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CAPSQ13938 189 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CBFBQ13951 182 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GIT2Q14161 759 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PTK2BQ14289 1009 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RABEP1Q15276 862 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC23BQ15437 767 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PFKFB4Q16877 469 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZACNQ401N2 412 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FUT10Q6P4F1 479 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HACE1Q8IYU2 909 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM184AQ8NB25 1140 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CNNM3Q8NE01 707 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ERMNQ8TAM6 284 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM71BQ8TC56 605 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HIC2Q96JB3 615 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 C8orf76Q96K31 380 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MYADMQ96S97 322 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PLIN2Q99541 437 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MARCH5Q9NX47 278 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS4AQ9UN37 437 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TECTAO75443 2155 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NID2Q14112 1375 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 IGF2RP11717 2491 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 AQP12BA6NM10 295 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC169A6NNP5 214 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LGALS16A8MUM7 142 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDH17O14917 1159 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCL16O15467 120 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAM12O43184 909 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DHHO43323 396 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ASNA1O43681 348 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 B3GAT3O94766 335 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGA5P08648 1049 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OR52Z1P0C646 297 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CDC25AP30304 524 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 AXLP30530 894 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ARL2P36404 184 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 POLE2P56282 527 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms