RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PPL8	197 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf78	A6NCI8	922 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BUI4	141 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	FRS3	O43559	492 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SGTA	O43765	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MFSD11	O43934	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CST8	O60676	142 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TJP3	O95049	919 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC2A3	P11169	496 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	AVPR2	P30518	371 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CCR1	P32246	355 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PLA2G5	P39877	138 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PAFAH1B1	P43034	410 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	NR2C2	P49116	596 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DNA2	P51530	1060 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	IRAK1	P51617	712 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CLCN5	P51795	746 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	EPHB3	P54753	998 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB1A	P62820	205 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	XRCC4	Q13426	336 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PTK6	Q13882	451 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ELF2	Q15723	593 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HECTD3	Q5T447	861 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ALLC	Q8N6M5	410 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	FLCN	Q8NFG4	579 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTL9	Q8TC94	416 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPH1	Q92598	858 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TDP1	Q9NUW8	608 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GDE1	Q9NZC3	331 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RAD54B	Q9Y620	910 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717		E9PAM4	449 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRRG1	O14668	218 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF197	O14709	1029 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPN9	O14815	690 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	KPNA5	O15131	536 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TTI1	O43156	1089 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PIP5K1C	O60331	668 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNG3	O60359	315 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PEX11B	O96011	259 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	PRNP	P04156	253 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	UQCRH	P07919	91 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	RHO	P08100	348 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	DES	P17661	470 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ERCC2	P18074	760 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TNFSF4	P23510	183 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC25C	P30307	473 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC6A4	P31645	630 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ELF1	P32519	619 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	GJC1	P36383	396 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	STAT5A	P42229	794 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DCTN1-222	ENST00000492717	MAGEA6	P43360	314 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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