RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490673.5

OPN3-206, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-206ENST00000490673 HID1Q8IV36 788 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PDXPQ96GD0 296 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 COX14Q96I36 57 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 IL26Q9NPH9 171 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TNFRSF10CO14798 259 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PYGLP06737 847 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 LRRC45Q96CN5 670 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 HIC2Q96JB3 615 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 SLC32A1Q9H598 525 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 KLQ9UEF7 1012 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 KCTD3Q9Y597 815 aa22.97■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 INPP4BO15327 924 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 APRTP07741 180 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 KELP23276 732 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 C4orf22Q6V702 233 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TRIM74Q86UV6 250 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 EID2Q8N6I1 236 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 LRRC61Q9BV99 259 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 RAD18Q9NS91 495 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 H3BM21 787 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 SCAMP1O15126 338 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 PHF2O75151 1096 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 POLD2P49005 469 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 BLKP51451 505 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 C1orf61Q13536 156 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 LINC00523Q86TU6 105 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 CLPBQ9H078 707 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 16.8
OPN3-206ENST00000490673 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.96■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.95■■□□□ 1.27
OPN3-206ENST00000490673 C2orf81A6NN90 581 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 E7EVH7 732 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TRIM38O00635 465 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 AQP9O43315 295 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 LDB2O43679 373 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 RASGRP1O95267 797 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 LMX1AQ8TE12 382 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 PKP3Q9Y446 797 aa22.95■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 PRSS38A1L453 326 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 PPFIA2O75334 1257 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TNFP01375 233 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 KRT14P02533 472 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 FNTAP49354 379 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 PPM1JQ5JR12 505 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TBATAQ96M53 351 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 SPASTQ9UBP0 616 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 NEMP2A6NFY4 417 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 LMAN1P49257 510 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 HS1BP3Q53T59 392 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 FFAR2O15552 330 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 CRTAMO95727 393 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 VPS41P49754 854 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 CDH17Q12864 832 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 POU6F1Q14863 301 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 TCEA2Q15560 299 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.93■■□□□ 1.26
OPN3-206ENST00000490673 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms