RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 CYC1P08574 325 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MYBL1P10243 752 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PIGAP37287 484 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MSH2P43246 934 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SUOXP51687 545 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ROR1Q01973 937 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 GPR18Q14330 331 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PTGR1Q14914 329 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CUL3-211ENST00000487558 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MMP21Q8N119 569 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CUL3-211ENST00000487558 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.8□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 A0A1W2PR77 199 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 A8MXE2 369 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 VNN2O95498 520 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 G6PDP11413 515 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 NAGAP17050 411 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 THPOP40225 353 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ARSEP51690 589 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 RAD23AP54725 363 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TMF1P82094 1093 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CXCL9Q07325 125 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MYBPC2Q14324 1141 aa5.79□□□□□ -1.48
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CUL3-211ENST00000487558 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MORN5Q5VZ52 161 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TMEM198Q66K66 360 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DLK2Q6UY11 383 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 AACSQ86V21 672 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DSELQ8IZU8 1212 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PTERQ96BW5 349 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 EGLN2Q96KS0 407 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 APOLD1Q96LR9 279 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.79□□□□□ -1.48
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CUL3-211ENST00000487558 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PIGMQ9H3S5 423 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 LNP1A1A4G5 178 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CPED1A4D0V7 1026 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 M0QZ24 198 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 VWA5AO00534 786 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ASAP2O43150 1006 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 GGPS1O95749 300 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 HSPA4LO95757 839 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ICAM1P05362 532 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 QDPRP09417 244 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MMP14P50281 582 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PPP5CP53041 499 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ECT2LQ008S8 904 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SREBF2Q12772 1141 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DLG2Q15700 870 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ZNF284Q2VY69 593 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CRY2Q49AN0 593 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MTX3Q5HYI7 312 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 Q6ZTK2 550 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CHST3Q7LGC8 479 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TMEM199Q8N511 208 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 RMDN1Q96DB5 314 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 NLRP4Q96MN2 994 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 MMP27Q9H306 513 aa5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CUL3-211ENST00000487558 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.78□□□□□ -1.48
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