RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, human

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNN3-206	ENST00000487539	VPS4B	O75351	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	UBXN7	O94888	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TDP2	O95551	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NFATC1	O95644	943 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	FGF19	O95750	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	KRT7	P08729	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	PPP3CB	P16298	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NTSR1	P30989	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	HSPA4	P34932	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NT5C2	P49902	561 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TPMT	P51580	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	PDE1A	P54750	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	VASH2	Q86V25	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	WBP2	Q969T9	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
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CNN3-206	ENST00000487539	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TULP3	O75386	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	PRKCG	P05129	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CKMT2	P17540	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	HDC	P19113	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
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CNN3-206	ENST00000487539	ACSL1	P33121	698 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	GNAQ	P50148	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
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CNN3-206	ENST00000487539	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TAF12	Q16514	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	FUT11	Q495W5	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	GABRG3	Q99928	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539		A0A1W2PPL8	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNN3-206	ENST00000487539	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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