RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A12O75746 678 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TPPPO94811 219 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 EGFP01133 1207 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ICAM1P05362 532 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RB1P06400 928 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CSH1P0DML2 217 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CSH2P0DML3 217 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SELLP14151 372 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ALOX12P18054 663 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GCH1P30793 250 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CAMPP49913 170 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SNX16P57768 344 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SPOCK1Q08629 439 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CDC16Q13042 620 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CUL4AQ13619 759 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACVR2BQ13705 512 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NFATC4Q14934 902 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DCAF6Q58WW2 860 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RAB41Q5JT25 222 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FJX1Q86VR8 437 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TIGD1Q96MW7 591 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LRFN5Q96NI6 719 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SH2D4AQ9H788 454 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SYNCQ9H7C4 482 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C1RLQ9NZP8 487 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 K7ENM7 598 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLPP2O43688 288 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MTA2O94776 668 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TNFRSF8P28908 595 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PSMB10P40306 273 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PIK3CAP42336 1068 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SUOXP51687 545 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TAS2R40P59535 323 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NEDD9Q14511 834 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 WTAPQ15007 396 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DLG2Q15700 870 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GSTA5Q7RTV2 222 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NRROSQ86YC3 692 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF34Q8IZ26 560 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SCML4Q8N228 414 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NME8Q8N427 588 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR8K5Q8NH50 307 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NEUROG1Q92886 237 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ORAI1Q96D31 301 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SCMH1Q96GD3 660 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF479Q96JC4 524 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SMC6Q96SB8 1091 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CMKLR1Q99788 373 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IL25Q9H293 177 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PDE7BQ9NP56 450 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OGFRQ9NZT2 677 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SWAP70Q9UH65 585 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PADI1Q9ULC6 663 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.26□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LACTBL1A8MY62 500 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SCAMP1O15126 338 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NDUFS3O75489 264 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 JRKO75564 520 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SERPINI2O75830 405 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KDM4BO94953 1096 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CLDN14O95500 239 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 AKR1B1P15121 316 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GPTP24298 496 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RAD52P43351 418 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCNJ4P48050 445 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms