RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THOP1P52888 689 aa16.54■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OLIG2Q13516 323 aa16.54■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.54■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STMN3Q9NZ72 180 aa16.54■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.53■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.53■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UQCRBP14927 111 aa16.53■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FIBCD1Q8N539 461 aa16.53■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC20A2Q08357 652 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTA3Q16772 222 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL23RQ5VWK5 629 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPPKQ9H8X2 491 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSC22D2O75157 780 aa16.52■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUT10Q6P4F1 479 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT73Q86Y46 540 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT14O95848 222 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELFN1P0C7U0 828 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IDH3AP50213 366 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYH6P13533 1939 aa16.52■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK14O94921 469 aa16.52■□□□□ 0.23
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