RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GPIP06744 558 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HTR1BP28222 390 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PLIN5Q00G26 463 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF15Q66K64 600 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CRTC3Q6UUV7 619 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LBX2Q6XYB7 198 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 UTS2BQ765I0 119 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00523Q86TU6 105 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HS3ST5Q8IZT8 346 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFP90Q8TF47 636 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC138Q96M89 665 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TUBB1Q9H4B7 451 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CRYL1Q9Y2S2 319 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 MCM3APO60318 1980 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ASPDHA6ND91 283 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FZD9O00144 591 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NCAM2O15394 837 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK14O94921 469 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NPR3P17342 541 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 AGXTP21549 392 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FPGSQ05932 587 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 MEP1AQ16819 746 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HECTD2Q5U5R9 776 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 BNIPLQ7Z465 357 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 STK32CQ86UX6 486 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 APPL2Q8NEU8 664 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT8Q8WV74 236 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 BIRC7Q96CA5 298 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP16Q9BY84 665 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NRCAMQ92823 1304 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DYTNA2CJ06 578 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CLDN25C9JDP6 229 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGES3LE9PB15 166 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 MTSS1O43312 755 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 JRKO75564 520 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 RECQL4O94761 1208 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HTR1AP08908 422 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 IMPDH1P20839 514 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 POLD2P49005 469 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4D2P58180 307 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ACAP2Q15057 778 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CLEC20AQ6ZU45 233 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SPARTQ8N0X7 666 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL10Q8N8L6 244 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC126Q96EE4 140 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CGREF1Q99674 301 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SIAEQ9HAT2 523 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 POLG2Q9UHN1 485 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF639Q9UID6 485 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM22Q9Y584 194 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 UBXN8O00124 270 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NOBOXO60393 691 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCB7O75027 752 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 INMTO95050 263 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FCGR1AP12314 374 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HRH2P25021 359 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNJ8Q15842 424 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PHKG1Q16816 387 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PFKFB4Q16877 469 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF34Q969K3 372 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TMBIM1Q969X1 311 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 NRBF2Q96F24 287 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 HGH1Q9BTY7 390 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TREX1Q9NSU2 369 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 RBP1P09455 135 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 ARSFP54793 590 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms