RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ABCG1P45844 678 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PLK5Q496M5 336 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ACAD11Q709F0 780 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 STRADAQ7RTN6 431 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 DEFB124Q8NES8 71 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SGF29Q96ES7 293 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 APOPT1Q96IL0 206 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC3Q9BY71 257 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CEP41Q9BYV8 373 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 USP3Q9Y6I4 520 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ACACAQ13085 2346 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ILVBLA1L0T0 632 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SIGLEC16A6NMB1 481 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 A8MX80 341 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PFDN6O15212 129 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FFAR2O15552 330 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 DFNA5O60443 496 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FESP07332 822 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FCARP24071 287 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PKNOX1P55347 436 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MAMLD1Q13495 774 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PTK2BQ14289 1009 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CSRP2Q16527 193 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CARD16Q5EG05 197 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CES3Q6UWW8 571 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 NPNTQ6UXI9 565 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 IFNEQ86WN2 208 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 HID1Q8IV36 788 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 EXOC2Q96KP1 924 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 IL36AQ9UHA7 158 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GVT2 93 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TTC34A8MYJ7 566 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 APOL1O14791 398 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 HRO43593 1189 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 LRP3O75074 770 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ELFN1P0C7U0 828 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 VCLP18206 1134 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFV2P19404 249 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CD38P28907 300 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PMLP29590 882 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 NUDT1P36639 197 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MAPKAPK2P49137 400 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MAPK10P53779 464 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 NOMO3P69849 1222 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PID1Q7Z2X4 250 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 AZIN2Q96A70 460 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 PPCSQ9HAB8 311 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 ACSS2Q9NR19 701 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 GALNT8Q9NY28 637 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 GRID1Q9ULK0 1009 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-205ENST00000468371 AKAP10O43572 662 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms