RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 TYROBPO43914 113 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 AVILO75366 819 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 VPS26AO75436 327 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 C1RP00736 705 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 DNAJB1P25685 340 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PRKAA2P54646 552 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SKP1P63208 163 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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USP54-210ENST00000466048 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.65□□□□□ -1.18
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USP54-210ENST00000466048 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.65□□□□□ -1.18
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USP54-210ENST00000466048 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.65□□□□□ -1.18
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USP54-210ENST00000466048 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.65□□□□□ -1.18
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USP54-210ENST00000466048 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.65□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.65□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.65□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 HLA-CQ95604 372 aa7.64□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.64□□□□□ -1.19
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USP54-210ENST00000466048 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.64□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KLF11O14901 512 aa7.64□□□□□ -1.19
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