RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OR4C6	Q8NH72	309 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HIC2	Q96JB3	615 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PRSS38	A1L453	326 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF10C	O14798	259 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PSMD3	O43242	534 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SOD1	P00441	154 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ETS1	P14921	441 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ADRA1A	P35348	466 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	POLD2	P49005	469 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC3	Q13217	504 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	KCTD16	Q68DU8	428 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RANBP10	Q6VN20	620 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GLRX5	Q86SX6	157 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GPR26	Q8NDV2	337 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RTP4	Q96DX8	246 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	WDR24	Q96S15	920 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CDH19	Q9H159	772 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PKP3	Q9Y446	797 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CACNA1B	Q00975	2339 aa		17.65	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SPEG	Q15772	3267 aa		17.64	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM5	P06731	702 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	BPI	P17213	487 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	HMGCL	P35914	325 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GNPDA1	P46926	289 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ1	P48048	391 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CLPB	Q9H078	707 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	MYLK	Q15746	1914 aa		17.64	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	C2orf81	A6NN90	581 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	LMO7DN	F2Z398	122 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	YY2	O15391	372 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	MYF5	P13349	255 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CKMT2	P17540	419 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FDFT1	P37268	417 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DCDC1	P59894	354 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GKN2	Q86XP6	184 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	COG1	Q8WTW3	980 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	APOLD1	Q96LR9	279 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TBATA	Q96M53	351 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PAK5	Q9P286	719 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SUFU	Q9UMX1	484 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SNX12	Q9UMY4	172 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ARL5A	Q9Y689	179 aa		17.63	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TPP1	O14773	563 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	CRTAM	O95727	393 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	AP2A1	O95782	977 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	GIMD1	P0DJR0	217 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TPH1	P17752	444 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PTPRCAP	Q14761	206 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PROX2	Q3B8N5	592 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	KCTD11	Q693B1	232 aa		17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	17.62	■□□□□ 0.41
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		17.62	■□□□□ 0.41

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