RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 AFMIDQ63HM1 303 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 DPPA4Q7L190 304 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM74Q86UV6 250 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NLRP14Q86W24 1093 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KCNMB4Q86W47 210 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM72BQ86X60 149 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PDE7BQ9NP56 450 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 USP25Q9UHP3 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SNX7Q9UNH6 387 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MED13LQ71F56 2210 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LRIG2O94898 1065 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 DRD2P14416 443 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FLT3P36888 993 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ETV3P41162 512 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PRCPP42785 496 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GPR1P46091 355 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RGRP47804 291 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 EPHA4P54764 986 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BCL2L1Q07817 233 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LLGL1Q15334 1064 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CDO1Q16878 200 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PYCR3Q53H96 274 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RAB6CQ53S08 254 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MIIPQ5JXC2 388 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 IYDQ6PHW0 289 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SRLQ86TD4 932 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SHC3Q92529 594 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 INPP5DQ92835 1189 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NT5C3BQ969T7 300 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SGSM3Q96HU1 749 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 COQ10AQ96MF6 247 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CHST11Q9NPF2 352 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C5AR2Q9P296 337 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RARRES3Q9UL19 164 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KCNK6Q9Y257 313 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FBN3Q75N90 2809 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 UBXN7O94888 489 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C9P02748 559 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CD99P14209 185 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CA5AP35218 305 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ADRA1BP35368 520 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KRT9P35527 623 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 VAV2P52735 878 aa7.1□□□□□ -1.27
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