RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 DCAF6Q58WW2 860 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PERM1Q5SV97 790 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AAGABQ6PD74 315 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ACAD11Q709F0 780 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA24Q86W54 205 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TDRPQ86YL5 185 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DENND1CQ8IV53 801 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRELID2Q8N945 189 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MGARPQ8TDB4 240 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MAML1Q92585 1016 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 USP7Q93009 1102 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 STMN2Q93045 179 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TNIP3Q96KP6 325 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 IL12RB2Q99665 862 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SMOQ99835 787 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PPCSQ9HAB8 311 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NMUR1Q9HB89 426 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM165Q9HC07 324 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SENP1Q9P0U3 644 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 A0A1W2PQH9 124 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 FKBP6O75344 327 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BEST1O76090 585 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GCNT3O95395 438 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRKAR1AP10644 381 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ANPEPP15144 967 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CREB1P16220 341 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AKT2P31751 481 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ATICP31939 592 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CASP5P51878 434 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 JAM2P57087 298 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ASPHQ12797 758 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CALCOCO2Q13137 446 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KYNUQ16719 465 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 LONRF1Q17RB8 773 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TRIM69Q86WT6 500 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 DTX1Q86Y01 620 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 AADATQ8N5Z0 425 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 BBOF1Q8ND07 529 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 OR13H1Q8NG92 308 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GDAP1Q8TB36 358 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 PRR7Q8TB68 274 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 LMX1AQ8TE12 382 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM159Q96B96 161 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MPP4Q96JB8 637 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 TTC25Q96NG3 672 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CGRRF1Q99675 332 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 CMKLR1Q99788 373 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 MIPEPQ99797 713 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC6-210ENST00000441703 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms