RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGB4Q8WW32 186 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NELFBQ8WX92 580 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF4BQ92750 862 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMM1Q92871 262 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35C1Q96A29 364 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf49Q96NF6 230 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPH1Q9BZG8 443 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD93Q9NPY3 652 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB20Q9NX57 234 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLK2Q9NYY3 685 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 EHD2Q9NZN4 543 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYLKQ15746 1914 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNA1BQ00975 2339 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACACBO00763 2458 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGF2RP11717 2491 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP13Q12802 2813 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKBKBO14920 756 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK13O15264 365 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KAT7O95251 611 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBB3O95704 486 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 APODP05090 189 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT5P13647 590 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRD1P21728 446 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCKDHBP21953 392 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMO5P49326 533 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOPP49908 381 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TKTL1P51854 596 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAT1P54687 386 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTBP1Q13363 440 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFIL3Q16649 462 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LONRF1Q17RB8 773 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTI2Q6NXR4 508 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM270Q6UE05 265 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRAGAQ7L523 313 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGZQ86VD9 579 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LONP2Q86WA8 852 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC93AQ86WB7 457 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMD1Q8N878 549 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TERB1Q8NA31 727 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDPRQ8NCN5 879 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KNL1Q8NG31 2342 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBA3Q8TBC4 463 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RLN3Q8WXF3 142 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NELL1Q92832 810 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAMP4Q969E2 229 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSDMAQ96QA5 445 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBS2Q9BXC9 721 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX101Q9BY14 249 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms