RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP2M1Q96CW1 435 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC38A3Q99624 504 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCG8Q9H221 673 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDP2Q9P2J9 529 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO6Q9UM54 1294 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCINQ9Y6U3 715 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RQS6 177 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYGLP06737 847 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1R2P27930 398 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB6P35237 376 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARC1Q5VT66 337 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF765Q7L2R6 523 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAMP4Q969E2 229 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF653Q96CK0 615 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTP4Q96DX8 246 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC53A6NM62 1247 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKX2-8O15522 239 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD6O60353 706 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K6O95382 1288 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDHA1P08559 390 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GZMAP12544 262 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF4P15884 667 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF30P17039 623 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN1A1P33908 653 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAP47Q5SQN1 464 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPH1Q92598 858 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX14Q96I36 57 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP2Q99490 1192 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTRCQ99895 268 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRY4Q9C004 299 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5MQ9NPB1 228 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANO10Q9NW15 660 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.08□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0J9YYE9 177 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MU76 341 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EML2O95834 649 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBC1P01850 177 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FTLP02792 175 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAR1AP10644 381 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASRP41180 1078 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MC2RQ01718 297 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HHEXQ03014 270 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTSQ03393 145 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC20Q12834 499 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCAPHQ15003 741 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASIC2Q16515 512 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX1AQ16623 288 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOLA3Q53S33 107 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP8Q86W28 1048 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM11Q96F44 468 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM14Q96QK8 99 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZPBPQ9BS86 351 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP4BO15327 924 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASMTLO95671 621 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RARAP10276 462 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STC1P52823 247 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXK1P85037 733 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX26Q8N6G2 289 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXD1Q8NHP7 514 aa13.06□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms