RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 LAMP2P13473 410 aa20.88■□□□□ 0.93
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GPC1-202ENST00000420138 STX3Q13277 289 aa20.88■□□□□ 0.93
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GPC1-202ENST00000420138 SORT1Q99523 831 aa20.85■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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GPC1-202ENST00000420138 MID2Q9UJV3 735 aa20.85■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 HCN2Q9UL51 889 aa20.85■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.85■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.85■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.84■□□□□ 0.93
GPC1-202ENST00000420138 ARNTLO00327 626 aa20.84■□□□□ 0.93
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