RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.07□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 LRTM1Q9HBL6 345 aa13.07□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 NECTIN3Q9NQS3 549 aa13.07□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CHST10O43529 356 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TLL1O43897 1013 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 NR2F6P10588 404 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 BRCC3P46736 316 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 JAM2P57087 298 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 KCNJ2P63252 427 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PLD4Q96BZ4 506 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 COQ7Q99807 217 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ABLIM1O14639 778 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 HAT1O14929 419 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 OMPP47874 163 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ACAP2Q15057 778 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 NDUFA9Q16795 377 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 BEND5Q7L4P6 421 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 BTBD9Q96Q07 612 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 A0A1W2PPM1 405 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 MCIDASD6RGH6 385 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 NFATC1O95644 943 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CHRNGP07510 517 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TACR2P21452 398 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 FAM171BQ6P995 826 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 AP2M1Q96CW1 435 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 EXOC2Q96KP1 924 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 MFSD11O43934 449 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PRMT3O60678 531 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TSPAN8P19075 237 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 POM121L1PQ3SYA9 428 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CRY2Q49AN0 593 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 METTL21CQ5VZV1 264 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 OMA1Q96E52 524 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 EXO5Q9H790 373 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 GMIPQ9P107 970 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PRNPP04156 253 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ALOX5P09917 674 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SLC7A2P52569 658 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 FUT2Q10981 343 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ITGA7Q13683 1181 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ACBD6Q9BR61 282 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.06□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 H0Y858 1186 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PIRTP0C851 137 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 OR1D2P34982 312 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 MYBPC1Q00872 1141 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RHAGQ02094 409 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TAF10Q12962 218 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TMC8Q8IU68 726 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CAB39LQ9H9S4 337 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 PLK4O00444 970 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CLDN9O95484 217 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SSR2P43308 183 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 GPR158Q5T848 1215 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CNTD1Q8N815 330 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ALG3Q92685 438 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CPXM1Q96SM3 734 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 UBAP1Q9NZ09 502 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 RAB23Q9ULC3 237 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TCAF1Q9Y4C2 921 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 TSPAN1O60635 241 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CDKN2BP42772 138 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 CDH24Q86UP0 819 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 LEMD2Q8NC56 503 aa13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TNS1-205ENST00000419504 MECRQ9BV79 373 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms