RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATG13O75143 517 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT37O76014 449 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT38O76015 456 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP1O94782 785 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBX18O95935 607 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 JCHAINP01591 159 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HMBSP08397 361 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTHP32929 405 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD151P48509 253 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 EMP3P54852 163 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NR1H2P55055 460 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 AQP4P55087 323 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GNA12Q03113 381 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 APOFQ13790 326 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF235Q14590 738 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DENND1CQ8IV53 801 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMYD1Q8NB12 490 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BIRC8Q96P09 236 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHF12Q96QT6 1004 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTKNQ9BST9 563 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL21Q9HBE4 155 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF292O60281 2723 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 I6L893 689 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 METTL18O95568 372 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RETP07949 1114 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NFKBIAP25963 317 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPA2P48052 419 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLD2P49005 469 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDE1BQ01064 536 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FOLH1Q04609 750 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 BST1Q10588 318 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DLG1Q12959 904 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCNIQ14094 377 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRM3Q14832 879 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 UGP2Q16851 508 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZNB5 142 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPWQ8N729 165 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 FNDC8Q8TC99 324 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CASS4Q9NQ75 786 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLLPQ9Y342 182 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPQQ9Y646 472 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.97□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 E9PBE3 544 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0Y626 953 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BNX3 289 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNK1O00180 336 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CBFA2T3O75081 653 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM63AO94886 807 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERPINF2P08697 491 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 HLA-DPA1P20036 260 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKCHP24723 683 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMB4P28070 264 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PEX2P28328 305 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 SSTR1P30872 391 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ELK3P41970 407 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 COPAP53621 1224 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMPRSS15P98073 1019 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDSRQ06136 332 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 CBX3Q13185 183 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDGFRLQ15198 375 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRIP10Q15642 601 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 NADK2Q4G0N4 442 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCID2Q5JVF3 399 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 STEAP4Q687X5 459 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCTD11Q693B1 232 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL31Q6EBC2 164 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.96□□□□□ -0.81
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms