RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPRE3Q9UPY8 281 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPAN19P0C672 248 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ATG10Q9H0Y0 220 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 STMN3Q9NZ72 180 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GNPDA1P46926 289 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 COLGALT2Q8IYK4 626 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CIB1Q99828 191 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 FAIM2Q9BWQ8 316 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH22Q9UJ99 828 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GVM2 712 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TCAF2A6NFQ2 919 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAP91O60641 907 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MPPE1Q53F39 396 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ITCHQ96J02 903 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A14Q9HCY8 104 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 STK16O75716 305 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP1P29972 269 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PDZK1Q5T2W1 519 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 BROXQ5VW32 411 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SPPL2CQ8IUH8 684 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 HEXDCQ8WVB3 486 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 FAXDC2Q96IV6 333 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SPACA7Q96KW9 195 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 NUAK2Q9H093 628 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 IPPKQ9H8X2 491 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CIDEBQ9UHD4 219 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAMEF1O95521 474 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TBX18O95935 607 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA7P48741 367 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM47BQ8NA70 645 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GOT2P00505 430 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 HTR7P34969 479 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC42P60953 191 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GLIS1Q8NBF1 620 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF540Q8NDQ6 660 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 LPGAT1Q92604 370 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF358Q9NW07 568 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SLIT2O94813 1529 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 TTKP33981 857 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GSTA3Q16772 222 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MPP5Q8N3R9 675 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEH1Q9H213 219 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-ND1P03886 318 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ETS2P15036 469 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 AMD1P17707 334 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCQ05315 142 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CERS6Q6ZMG9 384 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 NAT8LQ8N9F0 302 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 IKZF3Q9UKT9 509 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GNA13Q14344 377 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 IL23RQ5VWK5 629 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ARMC8Q8IUR7 673 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 UNC5BQ8IZJ1 945 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 OR7A2PQ8NGA2 310 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8D1Q8WZ84 308 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 SERHLQ9NQF3 203 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 IGSF9Q9P2J2 1179 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL16O15467 120 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 LAG3P18627 525 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-202ENST00000392011 GPAT3Q53EU6 434 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms