RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 MTBPQ96DY7 904 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SMC6Q96SB8 1091 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ASB8Q9H765 288 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CHRNB1P11230 501 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ITGALP20701 1170 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PRKCQQ04759 706 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TYSND1Q2T9J0 566 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LMNTD2Q8IXW0 634 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MDM1Q8TC05 714 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 OMDQ99983 421 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CD248Q9HCU0 757 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SNX15Q9NRS6 342 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 APPL1Q9UKG1 709 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MMP17Q9ULZ9 603 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.7■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PRR23AA6NEV1 266 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 NDUFS3O75489 264 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 DNTTP04053 509 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 GM2AP17900 193 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MGARPQ8TDB4 240 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 GPR22Q99680 433 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SPATA16Q9BXB7 569 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TMEM120BA0PK00 339 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 OR1I1O60431 355 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 C6P13671 934 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB8P50452 374 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R38P59533 333 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 NFATC2Q13469 925 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ZNF460Q14592 562 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 USP10Q14694 798 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 DBN1Q16643 649 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PPM1JQ5JR12 505 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FAM124AQ86V42 546 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SERPINA9Q86WD7 417 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ZNF398Q8TD17 642 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CXorf40AQ8TE69 158 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 62.8
LTV1-201ENST00000367576 FAM136AQ96C01 138 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FAM83DQ9H4H8 585 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CD93Q9NPY3 652 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SENP1Q9P0U3 644 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 WNT16Q9UBV4 365 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MUTYHQ9UIF7 546 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PCDH8O95206 1070 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 NDUFV2P19404 249 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TYK2P29597 1187 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FMO4P31512 558 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CLCN5P51795 746 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MPP2Q14168 576 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TMEM52BQ4KMG9 183 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ZNF549Q6P9A3 640 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SNX20Q7Z614 316 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ZNF687Q8N1G0 1237 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 HMGB4Q8WW32 186 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LPGAT1Q92604 370 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SGSM3Q96HU1 749 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PKNOX2Q96KN3 472 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 VPS11Q9H270 941 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FBRSQ9HAH7 460 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.68■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 FAM170BA6NMN3 283 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TTPAP49638 278 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 SUOXP51687 545 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 LRRC32Q14392 662 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TIFABQ6ZNK6 161 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 RAB7BQ96AH8 199 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 COQ10AQ96MF6 247 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 OLFM1Q99784 485 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 CD320Q9NPF0 282 aa17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.66■□□□□ 0.42
LTV1-201ENST00000367576 STK25O00506 426 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms