RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 NRP2O60462 931 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CD1DP15813 335 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SERINC3Q13530 473 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 IKBKEQ14164 716 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX31Q8N9S9 440 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR150Q8NGU9 434 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LPGAT1Q92604 370 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 MRASO14807 208 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 MUSKO15146 869 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6AP2O75787 350 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A1P02730 911 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9I1Q8NGQ6 314 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX13Q92968 403 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf60Q96EN9 201 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM92AA1XBS5 289 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 KLKB1P03952 638 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP1P13497 986 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEA11P43364 429 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RALGDSQ12967 914 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRRQ15256 657 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC26Q2I0M4 334 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 NADK2Q4G0N4 442 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA3CQ99985 751 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 COCHO43405 550 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 RAMP2O60895 175 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 GLP2RO95838 553 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SUOXP51687 545 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3BP2P78314 561 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 APOFQ13790 326 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP7Q14244 749 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 PARP15Q460N3 678 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 HACD3Q9P035 362 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CROTQ9UKG9 612 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL5AQ9Y689 179 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YJX3 145 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-CO1P00395 513 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF4P08620 206 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 GPX3P22352 226 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH13P55290 713 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF12Q16514 161 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 FEM1CQ96JP0 617 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 APPL1Q9UKG1 709 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV3-27P01718 113 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 GJA1P17302 382 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA3AQ14563 771 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 IYDQ6PHW0 289 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 AKTIPQ9H8T0 292 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 PADI4Q9UM07 663 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK14O94921 469 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 EPOP01588 193 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 CXCL10P02778 98 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF1P05230 155 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 COL6A1P12109 1028 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-DPA1P20036 260 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMB3Q13751 1172 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 RIN3Q8TB24 985 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB2Q96Q27 587 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO9BQ13459 2157 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFD2P13995 350 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A1P30825 629 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms