RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GABREP78334 506 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FOXK2Q01167 660 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HHEXQ03014 270 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CSRP2Q16527 193 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RBBP7Q16576 425 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF614Q8N883 585 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SNX24Q9Y343 169 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF839A8K0R7 811 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PJA2O43164 708 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CHEK2O96017 543 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KLKB1P03952 638 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RBL1P28749 1068 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 AIF1P55008 147 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANKS6Q68DC2 871 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NPNTQ6UXI9 565 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF3Q86WH2 238 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RBFAQ8N0V3 343 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CPXM2Q8N436 756 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ISCUQ9H1K1 167 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RUBCNLQ9H714 662 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KCND1Q9NSA2 647 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF711Q9Y462 761 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR5K4A6NMS3 321 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CSO75390 466 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RFPL3O75679 317 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN7O95471 211 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MT-CO3P00414 261 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ITIH2P19823 946 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TAC1P20366 129 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KDELR1P24390 212 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TYK2P29597 1187 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MC4RP32245 332 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FDFT1P37268 417 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OPRD1P41143 372 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 P2RY2P41231 377 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CXCR3P49682 368 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NUBP1P53384 320 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CDH17Q12864 832 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA9Q16795 377 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CABS1Q96KC9 395 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GLOD4Q9HC38 313 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SALL4Q9UJQ4 1053 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 THSD7BQ9C0I4 1608 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A088AWK7 358 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WFS1O76024 890 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MYF5P13349 255 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MCM3P25205 808 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HMOX2P30519 316 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ETV3P41162 512 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CASRP41180 1078 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MASP1P48740 699 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MC1RQ01726 317 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRNQ16849 979 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MPP7Q5T2T1 576 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CES3Q6UWW8 571 aa4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms