RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 C3orf18Q9UK00 162 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CPQQ9Y646 472 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ITPKAP23677 461 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SLC1A2P43004 574 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 IDH3AP50213 366 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CLCQ05315 142 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 KCNJ11Q14654 390 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 LPCAT4Q643R3 524 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OSTM1Q86WC4 334 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PLD4Q96BZ4 506 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TBX18O95935 607 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CST1P01037 141 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RALGDSQ12967 914 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 C9IYK1 514 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SERPINI2O75830 405 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 F2P00734 622 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 FAM163BP0C2L3 166 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GJA9P57773 515 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PRKCQQ04759 706 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CHPFQ8IZ52 775 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GPR88Q9GZN0 384 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 A0A088AWK7 358 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TSSK3Q96PN8 268 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 NMUR1Q9HB89 426 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PSME2Q9UL46 239 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 GNPDA1P46926 289 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 LCP2Q13094 533 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 FGF19O95750 216 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SUSD3Q96L08 255 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 B3GALT6Q96L58 329 aa20.65■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 SNAP91O60641 907 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RGS20O76081 388 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 AP1S1P61966 158 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 TCEAL1Q15170 157 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 CNTD1Q8N815 330 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 RHBGQ9H310 441 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 KLHL3Q9UH77 587 aa20.64■□□□□ 0.9
NISCH-201ENST00000345716 A0A0U1RQF3 1178 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 STK16O75716 305 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 PROSER1Q86XN7 944 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 IPPKQ9H8X2 491 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 VPS4AQ9UN37 437 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NRP1O14786 923 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 HCAR3P49019 387 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 GPX6P59796 221 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 XIAPP98170 497 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 PEX6Q13608 980 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 COL26A1Q96A83 441 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 UNCXA6NJT0 531 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NOS3P29474 1203 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 OR2T12Q8NG77 320 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 FIZ1Q96SL8 496 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-201ENST00000345716 FANCGO15287 622 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms