RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MAN1A2O60476 641 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 THPOP40225 353 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 GSK3BP49841 420 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MERTKQ12866 999 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MAPRE2Q15555 327 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 USP41Q3LFD5 358 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MIER2Q8N344 545 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PPM1MQ96MI6 270 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF225Q9UK10 706 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SARDHQ9UL12 918 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF711Q9Y462 761 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 J3QRK9 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 IL12AP29459 219 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RGRP47804 291 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 MTPNP58546 118 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 FBXL22Q6P050 247 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 GPR141Q7Z602 305 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 FBXL8Q96CD0 374 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 HCSTQ9UBK5 93 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PADI3Q9ULW8 664 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CLOCKO15516 846 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PSMD3O43242 534 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 KATNA1O75449 491 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 DGKQP52824 942 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 OR4D2P58180 307 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 LIPEQ05469 1076 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 BNIP3Q12983 259 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RNF145Q96MT1 663 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 HAUS8Q9BT25 410 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PLK2Q9NYY3 685 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 HAS3O00219 553 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 TNFRSF10BO14763 440 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 NIPSNAP2O75323 286 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RHOBTB1O94844 696 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 KCNH1O95259 989 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ITGB6P18564 788 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PBX3P40426 434 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CCR3P51677 355 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 OGFOD2Q6N063 350 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 METTL23Q86XA0 190 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ADAM2Q99965 735 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RNF112Q9ULX5 631 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CDH23Q9H251 3354 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 GIPC1O14908 333 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ACOX3O15254 700 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 ECI2O75521 394 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 GLP2RO95838 553 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 TCF3P15923 654 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 CLCQ05315 142 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 RBBP7Q16576 425 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 SYVN1Q86TM6 617 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT10-201ENST00000328834 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms