RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316433.8

ZNF540-201, Transcript of zinc finger protein 540, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF540, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF540-201ENST00000316433 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 LINC00587B1AMM8 73 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 F8W036 122 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF623O75123 536 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 RFPL1O75677 317 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 NPPAP01160 153 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 HSMCR30P0CW71 290 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 F8A1P23610 371 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PSMA3P25788 255 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MAOBP27338 520 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 IL12AP29459 219 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 BNC1Q01954 994 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 BAMBIQ13145 260 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SEMA3AQ14563 771 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SGCAQ16586 387 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 DGUOKQ16854 277 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CES4AQ5XG92 561 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF773Q6PK81 442 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 C16orf89Q6UX73 402 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PHC2Q8IXK0 858 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PALM2Q8IXS6 379 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PDIK1LQ8N165 341 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 WDR48Q8TAF3 677 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 BSNDQ8WZ55 320 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 LPPQ93052 612 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 FATE1Q969F0 183 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 FKBP10Q96AY3 582 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PHF21AQ96BD5 680 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ADI1Q9BV57 179 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 GINS2Q9Y248 185 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 KRT87PA6NCN2 255 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 H0YIN7 160 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF195O14628 629 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ARHGEF9O43307 516 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 TBX1O43435 398 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PROS1P07225 676 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 BPGMP07738 259 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SFTPCP11686 197 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF250P15622 560 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MTHFRP42898 656 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PRIM2P49643 509 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 TPMTP51580 245 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PLA2G16P53816 162 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MTM1Q13496 603 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 LLGL1Q15334 1064 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PKDCCQ504Y2 493 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 C8orf37Q96NL8 207 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 APOL6Q9BWW8 343 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 UCK2Q9BZX2 261 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 MID2Q9UJV3 735 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 LINC00862A6NCI5 91 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 SOCS2O14508 198 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF540-201ENST00000316433 APOA4P06727 396 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms