RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SLC22A2O15244 555 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CHRNB1P11230 501 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TAS2R39P59534 338 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RAB39AQ14964 217 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PCSK7Q16549 785 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RANBP10Q6VN20 620 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RNF135Q8IUD6 432 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CIB1Q99828 191 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 OSER1Q9NX31 292 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 E9PAM4 449 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KCNH1O95259 989 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DPP6P42658 865 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KDM1BQ8NB78 822 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HM13Q8TCT9 377 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 FAR2Q96K12 515 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MPP6Q9NZW5 540 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ELNP15502 786 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 IDUAP35475 653 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CARTPTQ16568 116 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KYQ8NBH2 561 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 OLFM1Q99784 485 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PALMDQ9NP74 551 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CDYLQ9Y232 598 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CAP1Q01518 475 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SERPINB11Q96P15 392 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 A0A087WXM4 84 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NR4A2P43354 598 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DNASE1L3Q13609 305 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NDUFA5Q16718 116 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PIGGQ5H8A4 983 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MTX3Q5HYI7 312 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SNX31Q8N9S9 440 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NPAS2Q99743 824 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RGS18Q9NS28 235 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KRT75O95678 551 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DCKP27707 260 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TM4SF4P48230 202 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GPR15P49685 360 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PLK1P53350 603 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DSC1Q08554 894 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NFATC3Q12968 1075 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 C16orf89Q6UX73 402 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ITIH5Q86UX2 942 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DOK1Q99704 481 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SH3GL1Q99961 368 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 IFT52Q9Y366 437 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms