RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 OTUB2Q96DC9 234 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 GPR21Q99679 349 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CEP44Q9C0F1 390 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 MARK1Q9P0L2 795 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NIPSNAP2O75323 286 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CA5AP35218 305 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 VIPR2P41587 438 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAA1Q13131 559 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 EPGNQ6UW88 154 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SLC30A3Q99726 388 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PFDN6O15212 129 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NPHS1O60500 1241 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF1O95521 474 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF2P50749 326 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SULT2A1Q06520 285 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DHCR24Q15392 516 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 OR4D1Q15615 310 aa22.65■■□□□ 1.22
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VSTM4-201ENST00000298454 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 EXT2Q93063 718 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC126Q96EE4 140 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.65■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 MATN2O00339 956 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 DMC1Q14565 340 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 AHI1Q8N157 1196 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SYTL2Q9HCH5 934 aa22.64■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 IL26Q9NPH9 171 aa22.64■■□□□ 1.21
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VSTM4-201ENST00000298454 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UGT2B4P06133 528 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 BPIP17213 487 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CALB2P22676 271 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN4P29074 926 aa22.63■■□□□ 1.21
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VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP8P85298 464 aa22.63■■□□□ 1.21
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VSTM4-201ENST00000298454 GRID2O43424 1007 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CYP17A1P05093 508 aa22.63■■□□□ 1.21
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VSTM4-201ENST00000298454 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PTGER3P43115 390 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NAT14Q8WUY8 206 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SCRN2Q96FV2 425 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CNDP1Q96KN2 507 aa22.63■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.63■■□□□ 1.21
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VSTM4-201ENST00000298454 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ASIC4Q96FT7 647 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 LYSMD1Q96S90 227 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 P2RY12Q9H244 342 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ASB8Q9H765 288 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TRANK1O15050 2925 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM233B4DJY2 109 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 F8W8V4 182 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 VPS26AO75436 327 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CHRM3P20309 590 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CPA2P48052 419 aa22.62■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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