RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 H3BM21 787 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC6O43699 453 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 DKK1O94907 266 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 RASGRP1O95267 797 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A1P02730 911 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SEMA5AQ13591 1074 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PROX2Q3B8N5 592 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TRIM74Q86UV6 250 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HIC2Q96JB3 615 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CDC6Q99741 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CDH19Q9H159 772 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 IL26Q9NPH9 171 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SPASTQ9UBP0 616 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 KCTD3Q9Y597 815 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ARL5AQ9Y689 179 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PRSS38A1L453 326 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 INPP4BO15327 924 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FFAR2O15552 330 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TNFP01375 233 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PYGLP06737 847 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 KELP23276 732 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CA5AP35218 305 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FDFT1P37268 417 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BLKP51451 505 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ALS2CLQ60I27 953 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ATL2Q8NHH9 583 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PAK5Q9P286 719 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 U3KQA8 63 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 MYLKQ15746 1914 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 YY2O15391 372 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 PSMD3O43242 534 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF14O43557 240 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 SUN1O94901 812 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 KCNA4P22459 653 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 GRIA1P42261 906 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 INAVAQ3KP66 663 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 CCDC89Q8N998 374 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 RAD18Q9NS91 495 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 SUFUQ9UMX1 484 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 NEMP2A6NFY4 417 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 LMO7DNF2Z398 122 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TPP1O14773 563 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 LDB2O43679 373 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TPH1P17752 444 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC3Q13217 504 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 CREG2Q8IUH2 290 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 WASF3Q9UPY6 502 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC6O75061 913 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 IVLP07476 585 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 ADRB1P08588 477 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 FTH1P19P0C7X4 201 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 MYF5P13349 255 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-201ENST00000236273 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms