RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 GRM3Q14832 879 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 DPPA4Q7L190 304 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FAM131BQ86XD5 332 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM51Q9NW97 253 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1CQ13936 2221 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.3■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 C9P02748 559 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FGF5P12034 268 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN4P29074 926 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 GFERP55789 205 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 APBA1Q02410 837 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 IL11RAQ14626 422 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP58Q5T655 872 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TRNP1Q6NT89 227 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SYVN1Q86TM6 617 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 COQ10AQ96MF6 247 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 OR2M4Q96R27 311 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C1Q96RD1 312 aa16.3■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.3■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 MT-ND3P03897 115 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A1P19634 815 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FLT3P36888 993 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK9P45984 424 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 NFATC2Q13469 925 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CYTH1Q15438 398 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SHC3Q92529 594 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 NUS1Q96E22 293 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 GPR87Q9BY21 358 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FAM72CH0Y354 149 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG6O75602 509 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TIAF1O95411 115 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ACOX1Q15067 660 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FAM72BQ86X60 149 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 MMP21Q8N119 569 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf72Q96LT7 481 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RASA4BC9J798 803 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RASA4O43374 803 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 LRIG2O94898 1065 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PTK2Q05397 1052 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 INPP5DQ92835 1189 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SYNCQ9H7C4 482 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SIX2Q9NPC8 291 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 GPR83Q9NYM4 423 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.27■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.27■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PCM1Q15154 2024 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PON1P27169 355 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 TEAD1P28347 426 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SCNN1AP37088 669 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RGRP47804 291 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SEPHS1P49903 392 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 SNX16P57768 344 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 PYCR3Q53H96 274 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 RAB6CQ53S08 254 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 DOK6Q6PKX4 331 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 GBP6Q6ZN66 633 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.26■□□□□ 0.19
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