RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 BROXQ5VW32 411 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SFRP1Q8N474 314 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SCAIQ8N9R8 606 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CASP10Q92851 521 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 VPS33AQ96AX1 596 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ZNF347Q96SE7 839 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 C19orf81C9J6K1 198 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TOR1BO14657 336 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 LDLRP01130 860 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ALBP02768 609 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 FCGR1AP12314 374 aa20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 MIER2Q8N344 545 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CCDC126Q96EE4 140 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TEX37Q96LM6 180 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TREX1Q9NSU2 369 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.47■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 IMPDH1P20839 514 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB6Q15916 424 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 DCAF15Q66K64 600 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PIM3Q86V86 326 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TUBB1Q9H4B7 451 aa20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 OSTM1Q86WC4 334 aa20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 SEPT3Q9UH03 358 aa20.46■□□□□ 0.87
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PMS1-222ENST00000639501 HTR1BP28222 390 aa20.45■□□□□ 0.86
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PMS1-222ENST00000639501 DIO3P55073 304 aa20.45■□□□□ 0.86
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PMS1-222ENST00000639501 DNASE1L3Q13609 305 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 IMPG1Q17R60 797 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 STARD8Q92502 1023 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 NTAN1Q96AB6 310 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 PTERQ96BW5 349 aa20.45■□□□□ 0.86
PMS1-222ENST00000639501 CHID1Q9BWS9 393 aa20.45■□□□□ 0.86
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