RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SETD4	Q9NVD3	440 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL17	Q9UF56	701 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PR77	199 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	C1orf226	A1L170	272 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SOCS6	O14544	535 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	AHCYL1	O43865	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	KCNJ13	O60928	360 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GJB3	O75712	270 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ALPL	P05186	524 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RB1	P06400	928 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CSH1	P0DML2	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CSH2	P0DML3	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CDC25A	P30304	524 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	STX2	P32856	288 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	KCNJ4	P48050	445 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	THBS3	P49746	956 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TFAP4	Q01664	338 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NFATC4	Q14934	902 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RAB41	Q5JT25	222 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF280D	Q6N043	979 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NRROS	Q86YC3	692 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	EGLN2	Q96KS0	407 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	IL25	Q9H293	177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NOX4	Q9NPH5	578 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	OGFR	Q9NZT2	677 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	EVPL	Q92817	2033 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ATP2A1	O14983	1001 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	INSIG1	O15503	277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RFPL2	O75678	378 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PGM3	O95394	542 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SRC	P12931	536 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM11	P17152	192 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PON1	P27169	355 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SSTR2	P30874	369 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ACSL1	P33121	698 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PRCP	P42785	496 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	CAMP	P49913	170 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GALC	P54803	685 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	LTB	Q06643	244 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	EPS8	Q12929	822 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GRIK2	Q13002	908 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	WTAP	Q15007	396 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PLCB4	Q15147	1175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NAB2	Q15742	525 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	DECR1	Q16698	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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