RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 RORBQ92753 470 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SCML2Q9UQR0 700 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C4AP0C0L4 1744 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 F2P00734 622 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DSC2Q02487 901 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GAD2Q05329 585 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LUZP2Q86TE4 346 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 HIC2Q96JB3 615 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FAM84AQ96KN4 292 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MARK4Q96L34 752 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MECRQ9BV79 373 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DTLQ9NZJ0 730 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 BTRCQ9Y297 605 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ESR1P03372 595 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GRIA3P42263 894 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RFX3P48380 749 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA1P56199 1179 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ABRQ12979 859 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DGUOKQ16854 277 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FGD3Q5JSP0 725 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CHSY3Q70JA7 882 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 BANPQ8N9N5 519 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC2Q96KP1 924 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf48Q96LL4 319 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 BTAF1O14981 1849 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0U1RQF3 1178 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 BCL10O95999 233 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM16LQ309B1 348 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DPP10Q8N608 796 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RCN3Q96D15 328 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF607Q96SK3 696 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TLE6Q9H808 572 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DEC1Q9P2X7 70 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf18Q9UK00 162 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MYL12BO14950 172 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PFKMP08237 780 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GSTM5P46439 218 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CDC73Q6P1J9 531 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL35Q6PF15 583 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf74Q86VG3 221 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ROPN1LQ96C74 230 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 MYH8P13535 1937 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN9O95484 217 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 21.6
PDE4D-228ENST00000636120 EPHA3P29320 983 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 JAG1P78504 1218 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RIPK1Q13546 671 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TAF5Q15542 800 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms