RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 DMTF1Q9Y222 760 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 VWA8A3KMH1 1905 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A0J9YYE9 177 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC12A8A0AV02 714 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 LCHNA4D1U4 455 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBXN8O00124 270 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCL22O00626 93 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 NME4O00746 187 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 STX16O14662 325 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIP5K1BO14986 540 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MUSKO15146 869 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRPA1O75762 1119 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC4A1P02730 911 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASGR1P07306 291 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRR35P0CG20 571 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6V1B2P21281 511 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRK4P32298 578 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACVRL1P37023 503 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALDH3B2P48448 385 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 STC1P52823 247 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 HUNKP57058 714 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 INHBEP58166 350 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP7Q14244 749 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 GK3PQ14409 553 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF235Q14590 738 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNA10Q16322 511 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 IYDQ6PHW0 289 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 HM13Q8TCT9 377 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIB2Q92519 343 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MGME1Q9BQP7 344 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAGEH1Q9H213 219 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 C8orf4Q9NR00 106 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 GID8Q9NWU2 228 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 THEGQ9P2T0 379 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 APPL1Q9UKG1 709 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARL5AQ9Y689 179 aa9.59□□□□□ -0.87
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 DYTNA2CJ06 578 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF839A8K0R7 811 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 H3BMM5 538 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 H3BNH8 94 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FXYD1O00168 92 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NR5A2O00482 541 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERPINF2P08697 491 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 COL6A1P12109 1028 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 IDO1P14902 403 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ETS2P15036 469 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF23P17027 643 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN8P19075 237 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPN3P20807 821 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CES1P23141 567 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ETFBP38117 255 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH13P55290 713 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TUBA4AP68366 448 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKCQQ04759 706 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLCQ05315 142 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAD51Q06609 339 aa9.58□□□□□ -0.88
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