RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622107.4

LTBP4-237, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-237ENST00000622107 GLMNQ92990 594 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 DTD2Q96FN9 168 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 COQ10AQ96MF6 247 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 FCRL5Q96RD9 977 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 LRRC61Q9BV99 259 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 KLQ9UEF7 1012 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.9□□□□□ -0.02
LTBP4-237ENST00000622107 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TPP1O14773 563 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 NDST3O95803 873 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TNFP01375 233 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 GP1BAP07359 652 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ETV3P41162 512 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 KIAA1024LP59773 190 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CYP4F3Q08477 520 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 20.8
LTBP4-237ENST00000622107 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 PNCKQ6P2M8 343 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF567Q8N184 647 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 AP2M1Q96CW1 435 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 OR1A2Q9Y585 309 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 U3KQA8 63 aa14.89□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 KNTC1P50748 2209 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 LMO7DNF2Z398 122 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 SLC4A1P02730 911 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ANXA6P08133 673 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MMP2P08253 660 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MYF5P13349 255 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 LHCGRP22888 699 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 WASHC5Q12768 1159 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ELOCQ15369 112 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 QPCTQ16769 361 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 AADACL2Q6P093 401 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 Q6ZVL8 140 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HID1Q8IV36 788 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 IPMKQ8NFU5 416 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 IFI44Q8TCB0 444 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 LYSMD1Q96S90 227 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 GBA3Q9H227 469 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CARD9Q9H257 536 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 UBP1Q9NZI7 540 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 RAXQ9Y2V3 346 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 OPA1O60313 960 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 GCATO75600 419 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CLDN7O95471 211 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MT-CO3P00414 261 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 EPOP01588 193 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HLA-DPA1P20036 260 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 RPIAP49247 311 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HK3P52790 923 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 STC1P52823 247 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 WNT3AP56704 352 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 DPTQ07507 201 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 C1orf61Q13536 156 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 PEX6Q13608 980 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 NR0B2Q15466 257 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CDKN3Q16667 212 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ALG11Q2TAA5 492 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 P3H1Q32P28 736 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 GKN2Q86XP6 184 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 MAPK15Q8TD08 544 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 BOCQ9BWV1 1114 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 CDH19Q9H159 772 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 TRABDQ9H4I3 376 aa14.87□□□□□ -0.03
LTBP4-237ENST00000622107 HACD3Q9P035 362 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms