RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 GLOD4Q9HC38 313 aa21.57■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 TTC34A8MYJ7 566 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 DFFAO00273 331 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 TPP1O14773 563 aa21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFS2O75306 463 aa21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 ERVK-10P10266 1014 aa21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 LIMK2P53671 638 aa21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 ARFIP2P53365 341 aa21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.56■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.55■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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SGMS1-210ENST00000619438 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0G2JND7 137 aa21.53■■□□□ 1.04
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