RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 PELI3Q8N2H9 469 aa26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 GATA6Q92908 595 aa26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SCAMP4Q969E2 229 aa26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.86■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 PRSS38A1L453 326 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 TMEM8BA6NDV4 472 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 NDST3O95803 873 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 PROS1P07225 676 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RBP3P10745 1247 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RBL1P28749 1068 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CDKN3Q16667 212 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 HES3Q5TGS1 186 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 NLRP8Q86W28 1048 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 TTC13Q8NBP0 860 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 TRIB3Q96RU7 358 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 GPR63Q9BZJ6 419 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 GULP1Q9UBP9 304 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 GPR34Q9UPC5 381 aa26.85■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 FAM149AA5PLN7 773 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SLC4A1P02730 911 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 GP1BAP07359 652 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CCDC175P0C221 793 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 MYF5P13349 255 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 AADACL2Q6P093 401 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 DOK6Q6PKX4 331 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RFLNAQ6ZTI6 216 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 IFI44Q8TCB0 444 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 FCRL5Q96RD9 977 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 BOCQ9BWV1 1114 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 FAM83DQ9H4H8 585 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 MAGEE1Q9HCI5 957 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 RAD18Q9NS91 495 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CACNA1BQ00975 2339 aa26.84■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 F5H423 210 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 CD68P34810 354 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SPINT3P49223 89 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 ST3GAL2Q16842 350 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 NAT6Q93015 286 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 TADA1Q96BN2 335 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 HIC2Q96JB3 615 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 FSD1LQ9BXM9 530 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 EPG5Q9HCE0 2579 aa26.83■■□□□ 1.89
BRD4-208ENST00000597315 KCNN4O15554 427 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ASMTLO95671 621 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 PIRTP0C851 137 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 WNT3AP56704 352 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 MPP3Q13368 585 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 PRPSAP1Q14558 356 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 SEL1L2Q5TEA6 688 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ARL10Q8N8L6 244 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 MAPK15Q8TD08 544 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 HERPUD2Q9BSE4 406 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 TMEM168Q9H0V1 697 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 PADI4Q9UM07 663 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ZNF711Q9Y462 761 aa26.82■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 INPP4BO15327 924 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ANXA9O76027 345 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 GNPDA1P46926 289 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 IPMKQ8NFU5 416 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 HES6Q96HZ4 224 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 GSDMCQ9BYG8 508 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 CDH19Q9H159 772 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.81■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 PTPRBP23467 1997 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 EPOP01588 193 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 CEACAM5P06731 702 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 GEMP55040 296 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 CLDN6P56747 220 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 PEX6Q13608 980 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 GUSBP11Q6P575 273 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 MARCH9Q86YJ5 346 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.8■■□□□ 1.88
BRD4-208ENST00000597315 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms