RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 NKAIN2Q5VXU1 208 aa12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 PIM3Q86V86 326 aa12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.07□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 ISCUQ9H1K1 167 aa12.07□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 AGAP2Q99490 1192 aa12.06□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 THAP2Q9H0W7 228 aa12.06□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 NT5MQ9NPB1 228 aa12.06□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa12.06□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 OR2M4Q96R27 311 aa12.05□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 CDH19Q9H159 772 aa12.05□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 STARD5Q9NSY2 213 aa12.05□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
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CTIF-208ENST00000590422 CLCA4Q14CN2 919 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 TBR1Q16650 682 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 PYCR3Q53H96 274 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 RALGPS1Q5JS13 557 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 BBS5Q8N3I7 341 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 OR4D9Q8NGE8 314 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-208ENST00000590422 SLC37A2Q8TED4 501 aa12.04□□□□□ -0.48
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