RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CPT1B	Q92523	772 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDKL2	Q92772	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM2	Q99965	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LCT	P09848	1927 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EVPL	Q92817	2033 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CIT	O14578	2027 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		A8MXQ7	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		I3L4J1	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MASP2	O00187	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PDHX	O00330	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BIRC5	O15392	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	B4GALT5	O43286	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY6	O43306	1168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TYROBP	O43914	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPAN1	O60635	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPDEF	O95238	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBED1	O96006	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EDN1	P05305	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2C9	P11712	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NEFH	P12036	1026 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TPSB2	P20231	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADORA2A	P29274	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HADHA	P40939	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF6	P49848	677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CPT1A	P50416	773 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH8	P55286	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IGBP1	P78318	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SP140	Q13342	867 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PDK1	Q15118	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMED2	Q15363	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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