RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RALA	P11233	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RORA	P35398	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PLK1	P53350	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	BIRC2	Q13490	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CDH18	Q13634	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IRF4	Q15306	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NCSTN	Q92542	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCL19	Q99731	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		A0A087WWV3	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AGPS	O00116	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	L1CAM	P32004	1257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OTX2	P32243	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NDST1	P52848	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PDE1A	P54750	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK7	Q13164	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DLG2	Q15700	870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LHPP	Q9H008	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SPTB	P11277	2137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MEN1	O00255	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AREL1	O15033	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC16A4	O15374	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TM7SF2	O76062	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IL18RAP	O95256	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF30	P17039	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KEL	P23276	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TACR1	P25103	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	2e-6	■■□□□ 13.5
MSI2-216	ENST00000582772	RCAN1	P53805	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms