RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 HDAC11Q96DB2 347 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC42Q96M95 316 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH9Q9HC56 1237 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1W2PQM1 296 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF487B1APH4 448 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CD48P09326 243 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CD82P27701 267 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FAF2Q96CS3 445 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJC7Q99615 494 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RAD18Q9NS91 495 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 WDR70Q9NW82 654 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PDHA1P08559 390 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC2A4P14672 509 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 KDELR1P24390 212 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ALDH4A1P30038 563 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC5A2P31639 672 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ADCY8P40145 1251 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ACTR1BP42025 376 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ACTR1AP61163 376 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CTBSQ01459 385 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PTSQ03393 145 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PDK1Q15118 436 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PHF19Q5T6S3 580 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DOK6Q6PKX4 331 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 AVL9Q8NBF6 648 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR2M4Q96R27 311 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LYSMD1Q96S90 227 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ABCG8Q9H221 673 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PISDQ9UG56 409 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CHKBQ9Y259 395 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FASNP49327 2511 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RP1P56715 2156 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRRD1A4D1F6 860 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ASMTLO95671 621 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FGF1P05230 155 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC1A1P43005 524 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 STC1P52823 247 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DSC2Q02487 901 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MESDQ14696 234 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NR1D2Q14995 579 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 AMZ1Q400G9 498 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CNGA4Q8IV77 575 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RNF157Q96PX1 679 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZMYND15Q9H091 742 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RMI1Q9H9A7 625 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 VPS18Q9P253 973 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CD84Q9UIB8 345 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NENFQ9UMX5 172 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms