RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ANKS6Q68DC2 871 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ARCQ7LC44 396 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM110Q86TL2 294 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PRR7Q8TB68 274 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 HES6Q96HZ4 224 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 NUP85Q9BW27 656 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MPP6Q9NZW5 540 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.32□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ILVBLA1L0T0 632 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 AREL1O15033 823 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 B4GAT1O43505 415 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SRGAP2O75044 1071 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 GRAP2O75791 330 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 RNF224P0DH78 156 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MPSTP25325 297 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ETFBP38117 255 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ARSDP51689 593 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PDCLQ13371 301 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TAF5Q15542 800 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CFAP58Q5T655 872 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PEX26Q7Z412 305 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 DAAM2Q86T65 1068 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PASD1Q8IV76 773 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CEP112Q8N8E3 955 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PBKQ96KB5 322 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZPBPQ9BS86 351 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CARD9Q9H257 536 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 POLHQ9Y253 713 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ITPR2Q14571 2701 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 B4E171 279 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MYO1FO00160 1098 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 GSRP00390 522 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 THRAP10827 490 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN7P41732 249 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 GPR3P46089 330 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ARF5P84085 180 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 GNA12Q03113 381 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MTM1Q13496 603 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PEX6Q13608 980 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ERV3-1Q14264 604 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ESPL1Q14674 2120 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 RPS6KA1Q15418 735 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 MYLK3Q32MK0 819 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ERAP2Q6P179 960 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 PLPP6Q8IY26 295 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ESX1Q8N693 406 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-215ENST00000560424 C18orf8Q96DM3 657 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms