RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 HID1Q8IV36 788 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LMX1AQ8TE12 382 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TLR10Q9BXR5 811 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCG8Q9H221 673 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 UBP1Q9NZI7 540 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PKP3Q9Y446 797 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf81A6NN90 581 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LMO7DNF2Z398 122 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LIASO43766 372 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP104O60308 925 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CRTAMO95727 393 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FGGP02679 453 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR89BP0CG08 455 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CKMT2P17540 419 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GM2AP17900 193 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PSMB4P28070 264 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LAMB3Q13751 1172 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 IHHQ14623 411 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RTP4Q96DX8 246 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 HIC2Q96JB3 615 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RMI1Q9H9A7 625 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 AP3B1O00203 1094 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CES2O00748 559 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GIPC1O14908 333 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RFPL3O75679 317 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 E2F1Q01094 437 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CDKN3Q16667 212 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A45Q8N413 288 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FICDQ9BVA6 458 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS18Q9P253 973 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PAK5Q9P286 719 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CD84Q9UIB8 345 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS38A1L453 326 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 E7EVH7 732 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FFAR2O15552 330 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ZW10O43264 779 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GP1BAP07359 652 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 IVLP07476 585 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ACP1P24666 158 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LMAN1P49257 510 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGA9Q13797 1035 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LRP8Q14114 963 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ALG11Q2TAA5 492 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 GSTA5Q7RTV2 222 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR48Q8TAF3 677 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 NAT6Q93015 286 aa15.71■□□□□ 0.11
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC61Q9BV99 259 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms